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Ebola Virus Computational Resources (EbolaVCR) is the in silico resources developed to facilitate scientific community fighting against deadly virus EBOLA. This server enlists possible vaccine candidates, therapeutic siRNAs and other related resources.
Reference: Dhanda et. al. (2016) A web-based resource for designing therapeutics against Ebola Virus. Sci Rep. 6:24782.
AntigenssGP
StrainTai-Forest Ebola Virus (TAFV)
Number of strain3
Gene IDgi_302315378
Protein IDYP_003815428.1
Mapped EpitopeVisualize
Sequence conservationVisualize Alignment
IDstartPeptideCTLMHC I allelesMHC I allele CountHLA allelesHLA allele Count MHC II allelesMHC II allele CountB cell epitopeInterferon-gamma inducerInterleukin-4 stimulator
15849Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)159 FFLYDRLAS NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150634N-0.22
15883Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)193 FFQSPPLHE NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0817, DRB1_13212N-0.28
15709Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)19 FFVWVIILF YHLA-A24, HLA-B*3701, HLA-B*3801, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-Cw*0401, HLA-Cw*0702, MHC-Ld9HLA-B*5102, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_13218N-0.99
15915Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)225 FGTNTTEFL NHLA-A2.1, HLA-B*3701, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B60, HLA-B7, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kb14NA0DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04263N0.14
15843Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)153 FHKEGAFFL YHLA-A2.1, HLA-B*3701, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B88HLA-A2, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_01056N0.08
15717Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)27 FHKVFSIPL NHLA-A2.1, HLA-B*0702, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-Cw*06028NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_01059N0.21
15873Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)183 FLILPKARK NHLA-A*1101, HLA-A20 Cattle, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-A68.1, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*54019NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_010533Y-0.12
15942Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)252 FLVLLNETI YHLA-A*0201, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B62, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Kd, MHC-Kk14HLA-A2, HLA-A24, HLA-A3, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0112DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_070311N-0.49
15850Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)160 FLYDRLAST NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5401, HLA-B62, HLA-B810NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_11077N0.10
15924Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)234 FQVDHLTYV YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5102, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B6213HLA-B14, HLA-B27, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*01, HLA-B*270312DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_11078N-0.39
15778Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)88 FRAGVPPKV YHLA-A2.1, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*54017HLA-B*51, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_11076N-0.48
15704Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)14 FRKTSFFVW NHLA-B*0702, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*54016NA0DRB1_0701, DRB1_07032N-0.07
15741Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)51 FVCRDKLSS NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_150233N-0.85
15710Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)20 FVWVIILFH NHLA-A*0201, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*54016NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_010534N-0.99
15980Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)290 FWENKKLHK NHLA-A1, HLA-B*51, HLA-B*54013NA0DRB1_11011N0.27
15871Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)181 IAFLILPKA NHLA-B40, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B*5801, HLA-B619NA0DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_13113N-0.99
15714Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)24 IILFHKVFS NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_150635N0.08
15859Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)169 IIYRGTTFA NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, MHC-Kb7NA0DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_132210N-0.07
15715Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)25 ILFHKVFSI YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B62, HLA-B8, MHC-Dd, MHC-Kk18HLA-A3, HLA-A*0301, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*01, HLA-A*680112DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150624N0.13
15875Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)185 ILPKARKDF NHLA-B*51, HLA-B*5801, HLA-B62, MHC-Ld4NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_132814N-0.41
15860Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)170 IYRGTTFAE NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_13042N-0.10
15950Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)260 IYSDNRRSN NMHC-Kd1NA0DRB1_11071N0.02
15801Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)111 LAIKKVDGS NHLA-B*4403, HLA-B*5102, HLA-B*51033NA0DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132820N-0.36
15760Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)70 LEGNGVATD NNA0NA0DRB1_0806, DRB1_13042N0.99
15725Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)35 LGVVHNNTL NHLA-A24, HLA-B14, HLA-B*3902, HLA-B40, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B7, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kb, MHC-Kd17NA0DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_15068N0.00
15874Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)184 LILPKARKD NNA0NA0DRB1_13041N-0.37
15753Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)63 LKSVGLNLE NNA0NA0DRB1_04101N-0.28
15758Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)68 LNLEGNGVA NHLA-B*51, HLA-B*53012NA0DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04263N-0.15
15733Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)43 LQVSDIDKF NHLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3902, HLA-B*4403, HLA-B*51, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B62, MHC-Ld9NA0DRB1_0301, DRB1_03092N-0.53
15943Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)253 LVLLNETIY NHLA-A3, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-Cw*0702, MHC-Db revised6NA0DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_01053N-0.48
15691Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)1 MGASGILQL NHLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B7, HLA-Cw*0401, MHC-Dd, MHC-Ld11NA0DRB1_0701, DRB1_07032N-0.22
15728Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)38 VHNNTLQVS NHLA-B*38011NA0DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_13228N-0.45
15870Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)180 VIAFLILPK NHLA-A*1101, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-A68.14NA0DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_150621N-0.99
15713Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)23 VIILFHKVF NHLA-A3, HLA-B*51, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B62, MHC-Ld6NA0DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_010520N-0.99
15944Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)254 VLLNETIYS NNA0NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132843N-0.69
15782Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)92 VPPKVVNCE NHLA-B*511NA0DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_13043N-0.99
15819Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)129 VRDFPRCRY YHLA-A1, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-Cw*07026HLA-A1, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, HLA-B35, Mamu-A*0111DRB1_0806, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_15067N0.02
15727Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)37 VVHNNTLQV YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-B*51, HLA-B*5103, MHC-Db, MHC-Db revised6HLA-A*0205, HLA-B*5301, HLA-B*51, HLA-B*0702, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*01, HLA-A*680214DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150647N-0.48
15711Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)21 VWVIILFHK NHLA-A*31011NA0DRB5_0101, DRB5_01052N-0.99
15981Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)291 WENKKLHKN NHLA-B40, HLA-B*4403, HLA-B*5401, HLA-B61, MHC-Kk5NA0DRB1_0801, DRB1_08172N0.03
15965Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)275 WKINPTVDT NHLA-A20 Cattle, HLA-B*51, HLA-B*54013NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_132322N-0.01
15712Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)22 WVIILFHKV YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A68.1, HLA-B*51, HLA-B*5102, HLA-B*5301, HLA-B*54017HLA-A31, HLA-B*5301, HLA-B*51, HLA-B8, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0113DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_010521N-0.99
15852Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)162 YDRLASTII NHLA-B*3701, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, MHC-Kk5NA0DRB1_0101, DRB1_04082N0.15
15903Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)213 YHTTTINYV NHLA-A2.1, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*54016NA0DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_07033N-0.02
15799Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)109 YNLAIKKVD NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_132312N-0.36
15861Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)171 YRGTTFAEG NHLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*54013NA0DRB1_04211N-0.06
15827Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)137 YVHKVSGTG NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_08176N0.99
15931Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)241 YVQLEARFT NHLA-A*0201, HLA-B*51, HLA-B*54013NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_010515N0.07
15910Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)220 YVVDNFGTN NHLA-B*51, HLA-B*5401, MHC-Db, MHC-Db revised4NA0DRB1_0305, DRB1_03092N0.99
15902Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)212 YYHTTTINY NHLA-B*0702, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-Cw*0401, HLA-Cw*07026NA0DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_010512N0.99